AURORA

Automated Unified Reproducible Omics Reporting & Analysis

시퀀싱 원자료를 사람이 바뀌어도 같은 결과가 나오는 형태로 처리합니다.

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사용자 정보

언어 모델

설명 칸 아래에서 분석 목적을 적으면 이 모델이 파이프라인 설정을 제안합니다. 연결되지 않은 모델을 고르면 그 자리에 알려 줍니다.

프로젝트 정보

만들면 rawdata · processed · report 세 폴더가 함께 생깁니다. 원자료는 rawdata 에 둡니다.

원자료 업로드 선택

원자료가 이미 서버에 있으면 건너뛰어도 됩니다 — 아래 원본 폴더에서 그 자리를 고르면 됩니다.

원본 폴더

위에서 고른 프로젝트 안에서 돌릴 원본 폴더를 고릅니다. 고르면 그 안의 FASTQ 를 훑어 시료를 짚어 줍니다.

시료 정보 (비교군 · 배치 · 시료 ID)

칸을 눌러 바로 고칩니다. 비교군(group)과 배치(batch)가 DEG 탭의 군집·배치 평가·DEG 를 결정합니다. 프로젝트에 저장해 두면 다음에 이 폴더를 고를 때 그대로 다시 나오고, 이미 끝난 작업이 있으면 완료 작업에 적용으로 그 작업의 시료표(리포트 Table 1)를 바꿀 수 있습니다.

참조 유전체·주석을 이 종으로 맞춥니다. 기본은 사람입니다.

원본 폴더를 고르면 여기에 시료가 나옵니다.

정량이 끝나면 DEG 탭에서 비교 페어와 분석 방법을 선택하세요.

파이프라인

원본 데이터와 분석 목적에 맞는 프리셋을 적용합니다. 이후 개별 옵션을 직접 수정할 수 있습니다.

AI 파이프라인 설정 제안

분석 목적을 입력하면 설정값을 제안합니다. 제안을 적용한 뒤 기존 실행 버튼으로 분석을 시작하세요.

입력한 목적과 선택한 데이터 유형·종만 모델에 전달합니다. 경로·로그·인증정보는 입력하지 마세요.

품질 검사
트리밍

정렬
중복 제거
변이 검출 · 주석
발현 정량 (RNA)
복제수 변이
R 객체 생성
실행 자원

실행 계획

분석 대상

끝난 작업의 결과로 분석합니다 — RNA-seq · miRNA-seq 는 카운트로 배치 평가·군집·DEG·GO 를, WGS · WES · BarSEQ 는 주석 변이·복제수 결과로 변이 요약·반복 변이 유전자·TMB·시그니처·CNV 를 합니다. 프로젝트를 고르면 그 프로젝트의 가장 최근 완료 작업이 대상이 되고, 시료 그룹·배치·정상/종양은 전처리 탭의 시료 정보 표를 따릅니다. 결과는 작업 폴더에 저장되며 리포트 다시 생성 을 누르면 리포트에 실립니다.

배치 평가 · 비지도 군집 분석

정량이 끝난 작업의 유전자 카운트로 배치 효과를 평가하고 시료를 군집화합니다. 여기서 고른 배치 보정이 DEG 모델에도 적용됩니다.

GO / Pathway

DEG 탭의 결과 표에 올라 있는 DEG 결과(방금 돌린 것 또는 불러온 것)로 기능적 과대표현(Gene Ontology)을 분석합니다. 선별 기준은 그 표의 padj · p · |log2FC| 값을 그대로 따르고, 배경은 같은 DEG 검정에 포함된 유전자입니다.

작업 현황

사용자 설정