Biodatenanalyse mit Kontext
Kontextbewusste, reproduzierbare Analysen auf Basis aktueller Analysetechnologien.
Analyse von Expressionsdaten
Laden Sie eine Genexpressionsmatrix hoch und erhalten Sie sofort QC, hochvariable Gene, PCA und differenzielle Expression.
Eingabeformat: Spalte 1 = Genname, folgende Spalten = Expressionswerte je Probe (CSV, max. 5 MB)
Gruppen werden aus dem Präfix des Probennamens abgeleitet — z. B.: Ctrl_1, Trt_1
Diese Bereitstellung führt nur den Beispieldatensatz aus. Für die Analyse eigener CSV-Dateien sprechen Sie uns an.
Analyse läuft …
Hochvariable Gene
Gene mit der größten Varianz — sie treiben die Unterschiede zwischen den Proben.
Proben-PCA
Volcano-Plot der differenziellen Expression
Analyseplattformen
Analyseplattformen für den gesamten Forschungszyklus — von der Einzelzelle über räumliche Omics und die Integration medizinischer Daten bis zum Wirkstoffdesign.
Single Cell
Einzelzell-RNA-seq löst zelluläre Heterogenität und Zell-Zell-Interaktionen hochaufgelöst auf.
Spatial Biology
Wir kartieren die Genexpression unter Erhalt der räumlichen Koordinaten im Gewebe und lesen so den Kontext der Mikroumgebung.
Integration medizinischer Daten
Wir standardisieren und verknüpfen heterogene Daten — Omics, klinische Daten, Bildgebung — für integrierte Kohortenanalysen.
Wirkstoffdesign
Ein datengetriebener Workflow der Wirkstoffentwicklung, von der Zielsuche bis zum Screening von Kandidaten.
Serviceplattformen
Vier Webdienste für den gesamten Forschungszyklus — Sequenzierung, Analyse, Schreiben und Design.
NGS-Pipeline für Rohsequenzdaten
AURORA
Von FASTQ-Rohdaten über Qualitätskontrolle, Alignment, Duplikatentfernung, Variantendetektion bis zur Expressionsquantifizierung — Pipeline zusammenstellen, ausführen und Status sowie Ergebnisberichte an einem Ort verfolgen.
- Voreinstellungen für WGS, WES, RNA-seq, scRNA-seq und mehr
- Wahl der Werkzeuge für Alignment, Variantendetektion und Annotation (BWA/STAR, GATK, VEP)
- Statusverfolgung und Ergebnisberichte
KI-Analyseplattform für virtuelle Zellen und digitale Zwillinge
Cortex
Auf Omics-Daten trainierte KI-Modelle führen virtuelle Experimente und klinische Studien durch und simulieren Reaktionen auf Zell- und Gewebeebene.
- Integrierte Einzelzell- und räumliche Omics-Analyse
- Virtuelle Perturbationsexperimente
- Reproduzierbare Analyseberichte
KI-Assistent für Forschungsdokumente und Publikationen
BioWrit
Verknüpft Analyseergebnisse mit Literaturbelegen, entwirft Publikationen, Forschungsanträge und Berichte und ordnet Zitate und Formatierung automatisch.
- Entwürfe aus Ihren Analyseergebnissen
- Automatische Literaturrecherche und Zitationspflege
- Vorlagen für Journal-Formate
Plattform für strukturbasiertes Peptiddesign und -optimierung
PepDesigner
Ausgehend von der Zielproteinstruktur werden bindende Peptide entworfen und Kandidatensequenzen nach vorhergesagter Affinität, Stabilität und physikochemischen Eigenschaften priorisiert.
- Sequenzgenerierung aus der Zielstruktur
- Bewertung von Affinität und Stabilität
- Ranking und Export der Kandidaten